擅自改变武器装备编配用途罪的立案标准主要依据《刑法》第四百三十七条，当行为造成严重后果时，如任务失败、人员伤亡或财产损失等，将依法追究刑事责任。若不及时处理，将影响军事行动的效果，甚至可能危及国家安全。
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