在村里土地纠纷中，即使有土地证但对方不认可时，应先尝试通过协商解决。如协商无果，可以向乡级或县级人民政府申请处理。根据《中华人民共和国农村土地承包法》第五十五条规定，当事人不愿协商、调解或者协商、调解不成的，可以向农村土地承包仲裁机构申请仲裁，也可以直接向人民法院起诉。
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