肇事顶包司机的处罚针对车主。根据《治安管理处罚法》和《刑法》的相关规定，顶包行为将受到法律制裁。根据情节轻重，可能面临警告、罚款、拘留等行政处罚，严重者可能面临有期徒刑。若涉及刑事犯罪，后果更为严重，可能会被判处三年以上十年以下有期徒刑。因此，建议车主在发生交通事故时，不要采取顶包行为，积极配合调查处理。
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